MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_009484	CGC	2	6	213948	213953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259207
5503	NC_009484	GGA	2	6	213966	213971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259207
5504	NC_009484	TCG	2	6	213983	213988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259207
5505	NC_009484	CG	3	6	214010	214015	0 %	0 %	50 %	50 %	148259207
5506	NC_009484	CGC	2	6	214023	214028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259207
5507	NC_009484	CGG	2	6	214031	214036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259207
5508	NC_009484	GTG	2	6	214063	214068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259207
5509	NC_009484	CCG	2	6	214076	214081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259207
5510	NC_009484	CG	3	6	214089	214094	0 %	0 %	50 %	50 %	148259207
5511	NC_009484	CGA	2	6	214158	214163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259207
5512	NC_009484	TGG	2	6	214184	214189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259207
5513	NC_009484	GCT	2	6	214191	214196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259207
5514	NC_009484	GC	3	6	214209	214214	0 %	0 %	50 %	50 %	148259207
5515	NC_009484	GTG	2	6	214225	214230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259207
5516	NC_009484	CCG	2	6	214235	214240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259207
5517	NC_009484	CGC	2	6	214251	214256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259207
5518	NC_009484	CG	4	8	214276	214283	0 %	0 %	50 %	50 %	148259207
5519	NC_009484	GCG	2	6	214318	214323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259207
5520	NC_009484	GGC	3	9	214326	214334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259207
5521	NC_009484	GC	3	6	214333	214338	0 %	0 %	50 %	50 %	148259207
5522	NC_009484	GACGC	2	10	214345	214354	20 %	0 %	40 %	40 %	148259207
5523	NC_009484	CGGC	2	8	214422	214429	0 %	0 %	50 %	50 %	148259207
5524	NC_009484	GTC	2	6	214435	214440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259207
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5526	NC_009484	GGGCG	2	10	214488	214497	0 %	0 %	80 %	20 %	148259207
5527	NC_009484	GGC	2	6	214506	214511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259207
5528	NC_009484	CAG	2	6	214528	214533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259207
5529	NC_009484	GCC	2	6	214537	214542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259207
5530	NC_009484	CGA	2	6	214548	214553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259207
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5533	NC_009484	ACT	2	6	214608	214613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259207
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5538	NC_009484	CTTG	2	8	214788	214795	0 %	50 %	25 %	25 %	148259207
5539	NC_009484	CGG	2	6	214832	214837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259207
5540	NC_009484	TCG	3	9	214847	214855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259207
5541	NC_009484	GGGC	2	8	214926	214933	0 %	0 %	75 %	25 %	148259207
5542	NC_009484	CA	3	6	214940	214945	50 %	0 %	0 %	50 %	148259207
5543	NC_009484	CGG	3	9	214989	214997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259207
5544	NC_009484	GCT	2	6	215001	215006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259207
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5550	NC_009484	AGGCGG	2	12	215126	215137	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148259207
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5552	NC_009484	GCGCG	2	10	215145	215154	0 %	0 %	60 %	40 %	148259207
5553	NC_009484	CGG	2	6	215156	215161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259207
5554	NC_009484	GCC	2	6	215191	215196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259207
5555	NC_009484	CGG	2	6	215238	215243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259207
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5562	NC_009484	CGG	2	6	215385	215390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259207
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5564	NC_009484	GCT	3	9	215460	215468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259207
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5593	NC_009484	GCT	2	6	216440	216445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259208
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5601	NC_009484	GGCG	2	8	216599	216606	0 %	0 %	75 %	25 %	148259208
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5622	NC_009484	CG	3	6	217259	217264	0 %	0 %	50 %	50 %	148259209
5623	NC_009484	GCC	3	9	217289	217297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259209
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5742	NC_009484	GCC	2	6	220689	220694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259212
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5744	NC_009484	CG	3	6	220793	220798	0 %	0 %	50 %	50 %	148259213
5745	NC_009484	GCC	2	6	220814	220819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259213
5746	NC_009484	CTT	2	6	220884	220889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259213
5747	NC_009484	AGCCCG	2	12	220891	220902	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148259213
5748	NC_009484	TGC	2	6	220903	220908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259213
5749	NC_009484	CGA	2	6	220952	220957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259213
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5753	NC_009484	CCG	2	6	221147	221152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259213
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5760	NC_009484	GCC	3	9	221530	221538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259213
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5776	NC_009484	GCG	2	6	222208	222213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259213
5777	NC_009484	AGC	3	9	222214	222222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259213
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5780	NC_009484	GCA	2	6	222314	222319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259213
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5784	NC_009484	CGAGA	2	10	222420	222429	40 %	0 %	40 %	20 %	148259213
5785	NC_009484	GGGCGA	2	12	222488	222499	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148259213
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5788	NC_009484	CGA	2	6	222549	222554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259213
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5801	NC_009484	CGT	3	9	222852	222860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259213
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5818	NC_009484	CGC	2	6	223344	223349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259214
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5822	NC_009484	CCCGCC	2	12	223407	223418	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	148259214
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5829	NC_009484	GTCG	2	8	223635	223642	0 %	25 %	50 %	25 %	148259214
5830	NC_009484	AGC	2	6	223665	223670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259214
5831	NC_009484	CCG	3	9	223746	223754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259214
5832	NC_009484	GC	3	6	223755	223760	0 %	0 %	50 %	50 %	148259214
5833	NC_009484	CGTCGC	2	12	223771	223782	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148259214
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5835	NC_009484	CGC	5	15	223876	223890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259214
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5839	NC_009484	CCAGA	2	10	224014	224023	40 %	0 %	20 %	40 %	148259214
5840	NC_009484	CCG	2	6	224032	224037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259214
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5842	NC_009484	CAC	2	6	224164	224169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259214
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5845	NC_009484	CCG	2	6	224203	224208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259214
5846	NC_009484	GGC	2	6	224215	224220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259214
5847	NC_009484	CGCGT	2	10	224231	224240	0 %	20 %	40 %	40 %	148259214
5848	NC_009484	GGC	3	9	224272	224280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259214
5849	NC_009484	AGCCGC	2	12	224310	224321	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148259214
5850	NC_009484	GCT	2	6	224343	224348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259214
5851	NC_009484	GCG	2	6	224396	224401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259214
5852	NC_009484	CGA	2	6	224427	224432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259214
5853	NC_009484	ATC	2	6	224447	224452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259214
5854	NC_009484	CGG	2	6	224458	224463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259214
5855	NC_009484	CGC	2	6	224479	224484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259214
5856	NC_009484	CAG	2	6	224488	224493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259214
5857	NC_009484	AGC	2	6	224520	224525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259214
5858	NC_009484	GC	3	6	224589	224594	0 %	0 %	50 %	50 %	148259214
5859	NC_009484	GCCC	2	8	224615	224622	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5860	NC_009484	CGC	2	6	224629	224634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259215
5861	NC_009484	GC	3	6	224633	224638	0 %	0 %	50 %	50 %	148259215
5862	NC_009484	GCG	2	6	224643	224648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259215
5863	NC_009484	GCT	2	6	224653	224658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259215
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5865	NC_009484	GCC	2	6	224695	224700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259215
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5987	NC_009484	CTG	2	6	228755	228760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259217
5988	NC_009484	TACC	2	8	228834	228841	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5989	NC_009484	GC	3	6	228874	228879	0 %	0 %	50 %	50 %	148259218
5990	NC_009484	GGC	2	6	228882	228887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259218
5991	NC_009484	TCGG	2	8	228910	228917	0 %	25 %	50 %	25 %	148259218
5992	NC_009484	TCG	2	6	228935	228940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259218
5993	NC_009484	TCG	2	6	228997	229002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259218
5994	NC_009484	TCG	2	6	229009	229014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259218
5995	NC_009484	CGC	2	6	229088	229093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259218
5996	NC_009484	GATGGC	2	12	229110	229121	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148259218
5997	NC_009484	GC	3	6	229145	229150	0 %	0 %	50 %	50 %	148259218
5998	NC_009484	GCG	2	6	229183	229188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259218
5999	NC_009484	GCC	2	6	229209	229214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259218
6000	NC_009484	GCC	2	6	229266	229271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259218

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